공문에 따르면 추 장관은 서울중앙지검 수사팀이 윤 총장 본인과 가족, 측근 관련 의혹에 대해 독립적으로 수사토록 지휘했다. 수사 과정에서 대검찰청 등 상급자의 지휘감독을 받지 않고 독립적으로 수사한 이후 그 결과 만을 검찰총장에게 보고하도록 조치하도록 했다.
구체적으로 △㈜코바나 관련 협찬금 명목의 금품수수 사건 △도이치모터스 관련 주가조작 및 도이치파이낸셜 주식 매매 특혜 의혹 사건 △요양병원 운영 관련 불법 의료기관개설, 요양급여비 편취 사건과 관련 불입건 등 사건 무마 의혹 및 기타 투자 관련 고소사건 △전 용산세무서장 뇌물수수사건 및 관련 압수수색영장 기각과 불기소 등 사건 무마 의혹 등 사건이 공문에서 언급됐다.