서 교수의 행적을 둘러싸고 또 다른 의혹이 제기됐다. 국정원 수사 태스크포스팀에서 밝힌 서 교수가 돈을 받은 시기는 2011년 9월부터 10월까지이며, 공교롭게도 당시 서 교수는 국가브랜드위원회 위원으로 활동하고 있었다. 성신여대에서 객원교수로 근무하던 서 교수는 같은 해 정식 전임교수로 임용됐다.
서 교수가 2011년 위원으로 활동한 대통령 직속 국가브랜드위원회는 2009년 1월 22일 공식출범했다. 국가브랜드 제고 활동을 총괄, 지원하기 위해 출범한 이 위원회의 초대 위원장에는 이명박 전 대통령의 최측근인 어윤대 전 고려대 총장이 임명됐으며, 2대 위원장에는 이명박 정부 출범을 준비한 제17대 대통령직 인수위원회 출신 이배용 전 이화여대 총장이 임명됐다.
2009년 신설 및 운영에만 80억 원의 예산이 투입된 국가브랜드위원회는 2013년 1월 박근혜 정부가 들어서 폐지되기 전까지 330억 원의 예산을 지출했으나 이렇다 할 성과를 거두지 못했다는 비판을 받았다. 2011년 9월 열린 문화체육관광부 국정감사에서는 2200만 원의 업무추진비의 사용 목적을 밝히지 않았다는 지적을 받았으며, 2012년 10월 열린 국정감사에서는 4년간 단 3건의 안건만을 심의했다는 비판을 받기도 했다.
이 전 대통령의 측근으로 구성돼 혈세 낭비만 했다는 지적을 받았던 국가브랜드위원회의 흔적은 서 교수가 이사장을 맡고 있는 재단법인 ‘대한국인’에서도 찾을 수 있다. 재단법인 대한국인은 각계 인사들이 나라 사랑을 위한 다양한 프로젝트를 진행하기 위한 목적으로 지난해 1월 설립됐으며, 서 교수는 2016년 1월 22일 열린 첫 이사회에서 초대 이사장으로 추대됐다.