교육감인 공정택 후보가 당선되면서 예상되는 가장 큰 변화는 고교 진학 때 학생이 학교를 골라 지원할 수 있는 학교선택제가 도입되는 것이다. 이 제도는 현재 중학교 2학년 학생들이 고교에 진학하는 2010학년도부터 시행된다.
현재 서울지역 중학생은 고교에 진학할 때 거주지 학군에 있는 학교에 추첨 배정되지만, 학교선택제가 시행되면 학생들이 거주지에 구애 받지 않고 서울 전역의 고등학교 중 2곳을 선택해 지원할 수 있게 된다. 강북에 거주하는 학생이 강남지역 학교에 지원하고, 강남지역 학생이 강북지역 고교에 다닐 수 있는 것이다.
학교 간, 교사 간 경쟁도 강화될 것으로 보인다. 현재 시범 실시 중인 교원평가제가 모든 학교에서 학부모 등이 참여하는 방식으로 본격 실시된다.