처음 당선 때는 신한국당 소속
김대중 정부 출범 이후 정계개편 때 새정치국민회의에 입당
2000년 16대 총선에서는 새천년민주당 공천으로 재선에 성공
2004년 17대 총선에서는 노무현 대통령 탄핵의 역풍으로 인해 3위로 낙선
한동안 정계를 떠나있다가 2008년 18대 총선을 앞두고는 민주당을 탈당해 한나라당 공천을 신청, 1998년 당시의 탈당 전력이 문제가 되어 입당이 거부되자 무소속으로 출마해 3선에 성공
일각에서는 한나라당 입당 가능성이 가장 높은 의원중 한명으로 송훈석이 지목됐으나
정작 송훈석은 외려 이명박 정부에 대해 시종일관 비판적인 입장을 견지했고
결국 2011년 4월 2일 민주당에 입당했다.
2012년 19대 총선에서는 새누리당 정문헌 전의원에 밀려 낙선
박근혜 대통령 취임 이후로도 계속해서 정부를 비판하는 입장을 고수하고 있다가
2015년 12월 30일 더불어민주당 탈당....