먼 옛날, 마왕 파이몬은 어둠의 힘에 현혹된 타락한 인간들을 이끌고 세계를 정복하고자 하였다. 이에 인간들은 마왕을 봉인하기 위한 필사의 공격을 하였고, 간신히 봉인에 성공할 수 있었다. 그러나 마왕 파이몬을 따랐던 타락한 인간들은 어둠의 힘에서 벗어나지 못하고, 봉인을 파괴할 기회만을 노리며 어둠 속에 몸을 숨겼다. 마왕을 봉인했던 용사들은 어둠의 무리들로부터 봉인을 지키기 위하여 특수한 힘을 가진 인간들을 모아 자신들의 능력을 전수시켰고, 자신들의 힘을 젬에 봉인하여 먼 훗날 마왕이 부활의 조짐을 보일 때, 그 힘을 사용할 수 있도록 하였다. 그리하여 젬파이터들은 용사의 젬을 간직하며, 마왕의 부활을 막기 위해 봉인을 지키게 된 것이었다. 마왕 파이몬의 부활.. 그로부터 오랜 세월이 흐른 어느 날, 마왕 파이몬은 자신의 부활을 위해, 어둠 속에 몸을 숨기고 때를 기다리던 타락한 인간들에게 힘을 나눠주기 시작하였고, 그들은 마왕을 봉인한 마법진을 파괴하기 위해 용사의 후예들인 젬파이터들에게 공격을 가하기 시작하였다. 마왕을 봉인한 마법진은 가장 중심이 되는 마법진과 이 마법진의 힘을 유지시켜 주는 여러 개의 마법진으로 구성되어 있는데 이중 보조 마법진들은 세계의 주요도시에 숨겨져 있었다. 다크 가디언스는 오랜 세월동안 이들 보조 마법진들을 조사해왔고, 최근 들어 보조 마법진 중의 몇 개를 파괴하는데 성공하였다. 이후 마왕은 완전히 부활하지는 못했으나, 봉인의 힘이 약해진 틈을 이용해 다크 가디언스에게 자신의 힘이 담긴 젬을 만들어 낼 수 있게 하였고, 다크 가디언스는 이를 이용해 마왕의 부활을 위해 더욱 거센 공격을 가해 오고 있다. 그리하여 현재는 많은 보조 마법진들이 파괴된 상태이며, 봉인의 힘은 한계를 드러내고 있다. 더 이상의 보조 마법진이 파괴된다면, 마왕을 봉인한 중앙 마법진이 더 이상 마왕을 봉인할 수 없게 될 것 으로 보여, 이를 막기 위해 젬파이터들은 다크 가디언스의 전모를 밝혀내고 이들을 물리치고자 하고 있으며, 최악의 사태를 대비하여 용사의 젬을 전수 받을 최강의 젬파이터들을 선별하기 위해 ‘젬파이터 무한 대전‘을 개최하게 된다. 대부분의 젬파이터들은 각자의 특성에 따라 흩어져서 살아가고 있다. 그러나 마왕의 봉인을 지키고, 어둠의 무리에 맞서 싸우기 위해, 각 직업별 장로들이 모여 최고 위원회를 두고 젬파이터들을 전체적으로 지휘하고 있으며, 위원회 직속의 특수부대와 초급 젬파이터들을 훈련시키는 학교를 운영하고 있다. 최고 위원회 : 가장 영향력 있는 젬파이터의 장로들이 모인 단체. 12명의 장로로 구성 (클래스별로 3명씩). 용사의 젬을 관리하고 있으며, '젬파이터 무한대전'을 주관. 특수부대 : 각 직업의 실력 있는 상급자들로 구성되어 있으며, 최고 위원회의 명령에 따라 움직인다. 전체 인원과 부대의 수에 대해서는 최고 위원회만이 알고 있으며, ‘다크 가디언스’를 조사하는 부대, 마법진을 지키고 있는 부대, 최고 위원회를 경호하는 부대 등이 활동하고 있는 것으로 알려지고 있다. 학교 : 초급 젬파이터들이 일반인들에게 정체를 숨길 수 있도록, 겉으로는 일반적인 학교와 같은 모습을 가지고 있으며, 각각의 직업별 기초교육을 가르치고 있다. 그러나 상당수의 젬파이터들은 학교 보다는 은둔하고 있는 상급 젬파이터들에게 직접 젬파이터로서의 교육을 받고 있다. 과거 마왕을 따랐던 자들로서, 지금도 마왕의 부활을 위해 젬파이터들과 맞서 싸우는 단체. 그들 스스로는 ‘다크 가디언스’로 부르고 있다. 구체적인 조직의 규모 등은 알려져 있지 않고 있다. 젬파이터들과는 달리 마왕 파이몬의 힘이 담겨져 있는 젬을 사용하며, 젬파이터들을 제거하기 위해 ‘젬파이터 무한대전’이 벌어지는 장소 등을 공격하고 있으며, 마왕의 봉인을 완전히 파괴하기 위해 노력하고 있다